Den Backofen auf 200°C Ober-/Unterhitze vorheizen. Zwiebel und Knoblauchzehen schälen und in feine Würfel schneiden. Den Thunfisch sowie die Kapern in einem Sieb gut abtropfen lassen.
In einer Pfanne etwas Speiseöl (z.B. Olivenöl) erhitzen. Die Zwiebel- und Knoblauchwürfel darin glasig andünsten. Die passierten Tomaten hinzugeben und für etwa 10 Minuten bei mittlerer Hitze sanft einköcheln lassen. Nach Belieben mit Salz, Pfeffer und italienischen Kräutern würzen. Abschließend den Thunfisch und die Kapern vorsichtig unterheben und die Pfanne vom Herd nehmen.
Für die Béchamelsauce die Butter in einem Topf bei mittlerer Hitze vollständig schmelzen. Das Weizenmehl mit einem Schneebesen zügig einrühren und für etwa 1 Minute leicht anschwitzen lassen (Mehlschwitze).
Die Milch nach und nach unter ständigem Rühren mit dem Schneebesen zur Mehlschwitze gießen, um Klümpchenbildung zu vermeiden. Die Sauce aufkochen lassen, bis sie eine cremige und leicht andickende Konsistenz erreicht. Mit Salz, Pfeffer und einer Prise Muskatnuss abschmecken.
Den Boden der Auflaufform mit einer dünnen Schicht Béchamelsauce bestreichen. Darauf die erste Schicht Lasagneplatten legen. Anschließend abwechselnd die Thunfisch-Tomatensauce, etwas Béchamelsauce und weitere Lasagneplatten schichten. Die letzte Schicht sollte vollständig aus Béchamelsauce bestehen, sodass die oberen Nudelplatten gut bedeckt sind.
Den geriebenen Mozzarella gleichmäßig über der obersten Béchamelschicht verteilen. Die Lasagne auf mittlerer Schiene in den vorgeheizten Ofen schieben und für 35-40 Minuten backen, bis die Oberfläche goldbraun und knusprig ist.
Die Auflaufform aus dem Ofen nehmen und die Lasagne vor dem Anschneiden etwa 10 Minuten ruhen lassen. So festigen sich die Schichten und die Portionen lassen sich sauber servieren.